Doanh nghiệp khu chế xuất thu kho xưởng có được giảm thuế GTGT không?

1. Doanh nghiệp khu chế xuất là gì?

Theo Khoản 21 Điều 2 của Nghị định 35/2022/NĐ-CP, doanh nghiệp chế xuất là các doanh nghiệp chuyên thực hiện các hoạt động chế xuất trong các khu công nghiệp, khu chế xuất và khu kinh tế.

Doanh nghiệp chế xuất thường nằm trong các khu vực riêng biệt, được thiết kế đặc thù dành cho việc chế xuất, gọi là các phân khu công nghiệp. Những phân khu này được ngăn cách với bên ngoài bằng hệ thống tường rào, có cổng và cửa kiểm soát ra vào. Mục đích của việc này là để đảm bảo các điều kiện kiểm tra, giám sát và kiểm soát chặt chẽ của cơ quan hải quan cùng các cơ quan chức năng có liên quan.

2. Doanh nghiệp khu chế xuất thu kho xưởng có được giảm thuế GTGT không?

Theo quy định tại Điều 9 Thông tư 219/2013/TT-BTC, hàng hóa và dịch vụ bán hoặc cung cấp cho tổ chức, cá nhân trong khu phi thuế quan (như khu chế xuất) được coi là hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu. Nếu đáp ứng đủ các điều kiện theo quy định này, hàng hóa và dịch vụ đó sẽ được áp dụng thuế suất thuế GTGT 0%. Để chứng minh là doanh nghiệp chế xuất, có thể dựa trên Giấy chứng nhận đăng ký thành lập doanh nghiệp hoặc Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư.

Tuy nhiên, theo khoản 3 Điều 9 Thông tư 219/2013/TT-BTC (được sửa đổi bởi khoản 2 Điều 1 Thông tư 130/2016/TT-BTC), nếu cơ sở kinh doanh cung cấp dịch vụ liên quan đến kho bãi cho tổ chức trong khu phi thuế quan, thì dịch vụ này sẽ không được áp dụng thuế suất 0%. Ngoài ra, có thể tham khảo thêm một số công văn hướng dẫn liên quan:

Công văn 3118/TCT-CS năm 2014 về thuế suất thuế GTGT đối với dịch vụ cung cấp cho doanh nghiệp chế xuất do Tổng cục Thuế ban hành;

Công văn 4488/TCT-CS năm 2014 về thuế suất thuế GTGT đối với dịch vụ cung cấp cho doanh nghiệp chế xuất do Tổng cục Thuế ban hành;

Công văn 15080/CT-TTHT năm 2017 về thuế suất thuế GTGT đối với dịch vụ xuất khẩu do Cục Thuế thành phố Hà Nội ban hành.

3. Doanh nghiệp khu chế xuất có được hưởng ưu đãi thuế đầu tư không?

Theo Khoản 3 Điều 26 Nghị định 35/2022/NĐ-CP, doanh nghiệp chế xuất sẽ được hưởng các ưu đãi về đầu tư và chính sách thuế như đối với khu phi thuế quan, bắt đầu từ thời điểm mục tiêu đầu tư thành lập được ghi nhận trong Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư, Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư điều chỉnh, hoặc trong Giấy xác nhận đăng ký doanh nghiệp chế xuất do cơ quan có thẩm quyền cấp.

Sau khi hoàn tất việc xây dựng, doanh nghiệp chế xuất phải được cơ quan có thẩm quyền xác nhận đã đáp ứng các điều kiện về kiểm tra, giám sát hải quan trước khi chính thức đi vào hoạt động. Nếu doanh nghiệp không đáp ứng các điều kiện này, họ sẽ không được hưởng các chính sách thuế ưu đãi áp dụng cho khu phi thuế quan.

Quá trình kiểm tra, xác nhận và hoàn thiện các điều kiện về kiểm tra, giám sát hải quan sẽ được thực hiện theo các quy định về thuế xuất khẩu và thuế nhập khẩu.

Theo Điều 28a của Nghị định 134/2016/NĐ-CP (sửa đổi bổ sung bởi Nghị định 18/2021/NĐ-CP), doanh nghiệp chế xuất, được coi là khu phi thuế quan, cần đáp ứng các điều kiện sau:

• Có hàng rào cứng để ngăn cách với khu vực bên ngoài, cùng với cổng và cửa ra vào đảm bảo việc xuất nhập hàng hóa chỉ thông qua các điểm này.
• Có hệ thống camera giám sát 24/7 tại các cổng ra vào và các vị trí lưu trữ hàng hóa, kể cả vào ngày nghỉ, lễ. Dữ liệu từ hệ thống camera phải được kết nối với cơ quan hải quan và lưu trữ tại doanh nghiệp ít nhất 12 tháng.
• Sử dụng phần mềm quản lý hàng hóa nhập khẩu, không chịu thuế, để báo cáo quyết toán về tình trạng nhập - xuất - tồn của hàng hóa.

4. Các câu hỏi thường gặp

4.1. Doanh nghiệp trong khu chế xuất cho thuê kho xưởng cho doanh nghiệp khác trong khu chế xuất thì có phải nộp thuế không?

Không, các giao dịch giữa các doanh nghiệp trong khu chế xuất với nhau thường không chịu thuế GTGT vì được xem là giao dịch nội bộ trong khu chế xuất. Tuy nhiên, doanh nghiệp vẫn phải thực hiện các thủ tục kê khai thuế theo quy định để đảm bảo tính minh bạch trong hoạt động kinh doanh.

4.2. Thuế GTGT có áp dụng cho việc mua hàng hóa hoặc dịch vụ từ doanh nghiệp ngoài khu chế xuất không?

Có, khi doanh nghiệp khu chế xuất mua hàng hóa hoặc dịch vụ từ các doanh nghiệp ngoài khu chế xuất (tức là từ nội địa), thuế GTGT sẽ được áp dụng theo quy định hiện hành. Doanh nghiệp khu chế xuất có thể yêu cầu hoàn thuế GTGT nếu đủ điều kiện theo quy định.

4.3. Thủ tục miễn thuế GTGT cho doanh nghiệp khu chế xuất như thế nào?

Để được miễn thuế GTGT, doanh nghiệp khu chế xuất cần tuân thủ quy trình kê khai và chứng minh các giao dịch nằm trong diện miễn thuế. Thông thường, doanh nghiệp phải đăng ký mã số thuế và thực hiện kê khai theo quy định của cơ quan thuế.

4.4. Doanh nghiệp khu chế xuất có thể yêu cầu hoàn thuế GTGT khi mua hàng hóa, dịch vụ không?

Có, doanh nghiệp khu chế xuất có thể yêu cầu hoàn thuế GTGT đối với các khoản thuế GTGT đã nộp khi mua hàng hóa, dịch vụ từ doanh nghiệp nội địa nếu hàng hóa đó được sử dụng cho mục đích sản xuất và xuất khẩu.